Publications of Johannes Krause

Journal Article (190)

81.
Journal Article
Jeong, C.; Wilkin, S.; Amgalantugs, T.; Bouwman, A. S.; Taylor, W. T. T.; Hagan, R.; Bromage, S.; Tsolmon, S.; Trachsel, C.; Grossmann, J. et al.; Littleton, J.; Makarewicz, C. A.; Krigbaum, J.; Burri Promerová, M.; Scott, A.; Davaasambuu, G.; Wright, J.; Irmer, F.; Myagmar, E.; Boivin, N. L.; Robbeets, M.; Rühli, F. J.; Krause, J.; Frohlich, B.; Hendy, J.; Warinner, C. G.: Bronze Age population dynamics and the rise of dairy pastoralism on the eastern Eurasian steppe. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 115 (48), pp. E11248 - E11255 (2018)
82.
Journal Article
Posth, C.; Nakatsuka, N.; Lazaridis, I.; Skoglund, P.; Mallick, S.; Lamnidis, T. C.; Rohland, N.; Nägele, K.; Adamski, N.; Bertolini, E. et al.; Broomandkhoshbacht, N.; Cooper, A.; Culleton, B. J.; Ferraz da Silva, T.; Ferry, M.; Furtwängler, A.; Haak, W.; Harkins, K.; Harper, T. K.; Hünemeier, T.; Lawson, A. M.; Llamas, B.; Michel, M.; Nelson, E. A.; Oppenheimer, J.; Patterson, N.; Schiffels, S.; Sedig, J.; Stewardson, K.; Talamo, S.; Wang, C.-C.; Hublin, J.-J.; Hubbe, M.; Harvati, K.; Delaunay, A. N.; Beier, J.; Francken, M.; Kaulicke, P.; Reyes-Centeno, H.; Rademaker, K.; Trask, W. R.; Robinson, M.; Gutierrez, S. M.; Prufer, K. M.; Salazar-García, D. C.; Chim, E. N.; Gomes, L. M. P.; Alves, M. L.; Liryo, A.; Inglez, M.; Oliveira, R. E.; Bernardo, D. V.; Barioni, A.; Wesolowski, V.; Scheifler, N. A.; Rivera, M. A.; Plens, C. R.; Messineo, P. G.; Figuti, L.; Corach, D.; Scabuzzo, C.; Eggers, S.; DeBlasis, P.; Reindel, M.; Méndez, C.; Politis, G.; Tomasto-Cagigao, E.; Kennett, D. J.; Strauss, A.; Fehren-Schmitz, L.; Krause, J.; Reich, D.: Reconstructing the deep population history of Central and South America. Cell 175 (5), e22, pp. 1185 - 1197 (2018)
83.
Journal Article
Furtwängler, A.; Reiter, E.; Neumann, G. U.; Siebke, I.; Steuri, N.; Hafner, A.; Lösch, S.; Anthes, N.; Schuenemann, V. J.; Krause, J.: Ratio of mitochondrial to nuclear DNA affects contamination estimates in ancient DNA analysis. Scientific Reports 8, 14075 (2018)
84.
Journal Article
Knauf, S.; Gogarten, J. F.; Schuenemann, V. J.; Nys, D.; M., H.; Düx, A.; Strouhal, M.; Mikalová, L.; Bos, K. I.; Armstrong, R. et al.; Batamuzi, E. K.; Chuma, I. S.; Davoust, B.; Diatta, G.; Fyumagwa, R. D.; Kazwala, R. R.; Keyyu, J. D.; Lejora, I. A. V.; Levasseur, A.; Liu, H.; Mayhew, M. A.; Mediannikov, O.; Raoult, D.; Wittig, R. M.; Roos, C.; Leendertz, F. H.; Šmajs, D.; Nieselt, K.; Krause, J.; Calvignac-Spencer, S.: Nonhuman primates across sub-Saharan Africa are infected with the yaws bacterium Treponema pallidum subsp. pertenue. Emerging Microbes & Infections 7, 157 (2018)
85.
Journal Article
Amorim, C. E. G.; Vai, S.; Posth, C.; Modi, A.; Koncz, I.; Hakenbeck, S.; La Rocca, M. C.; Cristina, M.; Mende, B.; Bobo, D. et al.; Pohl, W.; Baricco, L. P.; Bedini, E.; Francalacci, P.; Giostra, C.; Vida, T.; Winger, D.; von Freeden, U.; Ghirotto, S.; Lari, M.; Barbujani, G.; Krause, J.; Caramelli, D.; Geary, P. J.; Veeramah, K. R.: Understanding 6th-century barbarian social organization and migration through paleogenomics. Nature Communications 9, 3547 (2018)
86.
Journal Article
O’Sullivan, N.; Posth, C.; Coia, V.; Schuenemann, V. J.; Price, T. D.; Wahl, J.; Pinhasi, R.; Zink, A.; Krause, J.; Maixner, F.: Ancient genome-wide analyses infer kinship structure in an Early Medieval Alemannic graveyard. Science Advances 4 (9), 1262 (2018)
87.
Journal Article
Galarza, J. M.; Barquera, R.; Álvarez, A. M. T.; Zaragoza, H.; I., D.; Sevilla, G. P.; Tamayo, A.; Pérez, M.; Dávila, D.; Birnberg, L. et al.; Alonzo, V. A.; Krause, J.; Grijalva, M.: Genetic diversity of the HLA system in human populations from the Sierra (Andean), Oriente (Amazonian) and Costa (Coastal) regions of Ecuador. Human Immunology 79 (9), pp. 639 - 650 (2018)
88.
Journal Article
Eisenmann, S.; Bánffy, E.; van Dommelen, P.; Hofmann, K. P.; Maran, J.; Lazaridis, I.; Mittnik, A.; McCormick, M.; Krause, J.; Reich, D. et al.; Stockhammer, P. W.: Reconciling material cultures in archaeology with genetic data: The nomenclature of clusters emerging from archaeogenomic analysis. Scientific Reports 8, 13003 (2018)
89.
Journal Article
Mann, A.; Sabin, S.; Ziesemer, K.; Vågene, Å. J.; Schroeder, H.; Ozga, A. T.; Sankaranarayanan, K.; Hofman, C. A.; Fellows Yates, J. A.; Salazar-García, D. C. et al.; Frohlich, B.; Aldenderfer, M.; Hoogland, M.; Read, C.; Milner, G. R.; Stone, A. C.; Lewis, C. M.; Krause, J.; Hofman, C.; Bos, K. I.; Warinner, C. G.: Differential preservation of endogenous human and microbial DNA in dental calculus and dentin. Scientific Reports 8 (1), 9822 (2018)
90.
Journal Article
Schuenemann, V. J.; Lankapalli, A. K.; Barquera, R.; Nelson, E. A.; Iraíz Hernández, D.; Acuña Alonzo, V.; Bos, K. I.; Márquez Morfín, L.; Herbig, A.; Krause, J.: Historic Treponema pallidum genomes from Colonial Mexico retrieved from archaeological remains. PLOS Neglected Tropical Diseases 12 (6), e0006447 (2018)
91.
Journal Article
Spyrou, M. A.; Tukhbatova, R. I.; Wang, C.-C.; Andrades Valtueña, A.; Lankapalli, A. K.; Kondrashin, V. V.; Tsybin, V. A.; Khokhlov, A.; Kühnert, D.; Herbig, A. et al.; Bos, K. I.; Krause, J.: Analysis of 3800-year-old Yersinia pestis genomes suggests Bronze Age origin for bubonic plague. Nature Communications 9, 2234 (2018)
92.
Journal Article
Schuenemann, V. J.; Avanzi, C.; Krause-Kyora, B.; Seitz, A.; Herbig, A.; Inskip, S.; Bonazzi, M.; Reiter, E.; Urban, C.; Dangvard Pedersen, D. et al.; Taylor, G. M.; Singh, P.; Stewart, G. R.; Velemínský, P.; Likovsky, J.; Marcsik, A.; Molnár, E.; Pálfi, G.; Mariotti, V.; Riga, A.; Belcastro, M. G.; Boldsen, J. L.; Nebel, A.; Mays, S.; Donoghue, H. D.; Zakrzewski, S.; Benjak, A.; Nieselt, K.; Cole, S. T.; Krause, J.: Ancient genomes reveal a high diversity of Mycobacterium leprae in medieval Europe. PLoS Pathogens 14 (5), pp. 1 - 17 (2018)
93.
Journal Article
Krause-Kyora, B.; Susat, J.; Key, F. M.; Kühnert, D.; Bosse, E.; Immel, A.; Rinne, C.; Kornell, S.-C.; Yepes, D.; Franzenburg, S. et al.; Heyne, H. O.; Meier, T.; Lösch, S.; Meller, H.; Friederich, S.; Nicklisch, N.; Alt, K. W.; Schreiber, S.; Tholey, A.; Herbig, A.; Nebel, A.; Krause, J.: Neolithic and medieval virus genomes reveal complex evolution of Hepatitis B. eLife 7, e36666 (2018)
94.
Journal Article
Hajdinjak, M.; Fu, Q.; Hübner, A.; Petr, M.; Mafessoni, F.; Grote, S.; Skoglund, P.; Narasimham, V.; Rougier, H.; Crevecoeur, I. et al.; Semal, P.; Soressi, M.; Talamo, S.; Hublin, J.-J.; Gušić, I.; Kućan, Ž.; Rudan, P.; Golovanova, L. V.; Doronichev, V. B.; Posth, C.; Krause, J.; Korlević, P.; Nagel, S.; Nickel, B.; Slatkin, M.; Patterson, N.; Reich, D.; Prüfer, K.; Meyer, M.; Pääbo, S.; Kelso, J.: Reconstructing the genetic history of late Neanderthals. Nature 555 (7695), 26151, pp. 652 - 656 (2018)
95.
Journal Article
Loosdrecht, M. S. v. d.; Bouzouggar, A.; Humphrey, L.; Posth, C.; Barton, N.; Aximu-Petri, A.; Nickel, B.; Nagel, S.; Talbi, E. H.; Hajraoui, M. A. E. et al.; Amzazi, S.; Hublin, J.-J.; Pääbo, S.; Schiffels, S.; Meyer, M.; Haak, W.; Jeong, C.; Krause, J.: Pleistocene North African genomes link near Eastern and sub-Saharan African human populations. Science 360 (6388), pp. 548 - 552 (2018)
96.
Journal Article
Mathieson, I.; Alpaslan-Roodenberg, S.; Posth, C.; Szécsényi-Nagy, A.; Rohland, N.; Mallick, S.; Olalde, I.; Broomandkhoshbacht, N.; Candilio, F.; Cheronet, O. et al.; Fernandes, D.; Ferry, M.; Gamarra, B.; Fortes, G. G.; Haak, W.; Harney, E.; Jones, E.; Keating, D.; Krause-Kyora, B.; Kucukkalipci, I.; Michel, M.; Mittnik, A.; Nägele, K.; Novak, M.; Oppenheimer, J.; Patterson, N.; Pfrengle, S.; Sirak, K.; Stewardson, K.; Vai, S.; Alexandrov, S.; Alt, K. W.; Andreescu, R.; Antonović, D.; Ash, A.; Atanassova, N.; Bacvarov, K.; Gusztáv, M. B.; Bocherens, H.; Bolus, M.; Boroneanţ, A.; Boyadzhiev, Y.; Budnik, A.; Burmaz, J.; Chohadzhiev, S.; Conard, N. J.; Cottiaux, R.; Čuka, M.; Cupillard, C.; Drucker, D. G.; Elenski, N.; Francken, M.; Galabova, B.; Ganetsovski, G.; Gély, B.; Hajdu, T.; Handzhyiska, V.; Harvati, K.; Higham, T.; Iliev, S.; Janković, I.; Karavanić, I.; Kennett, D. J.; Komšo, D.; Kozak, A.; Labuda, D.; Lari, M.; Lazar, C.; Leppek, M.; Leshtakov, K.; Vetro, D. L.; Los, D.; Lozanov, I.; Malina, M.; Martini, F.; McSweeney, K.; Meller, H.; Menđušić, M.; Mirea, P.; Moiseyev, V.; Petrova, V.; Price, T. D.; Simalcsik, A.; Sineo, L.; Šlaus, M.; Slavchev, V.; Stanev, P.; Starović, A.; Szeniczey, T.; Talamo, S.; Teschler-Nicola, M.; Thevenet, C.; Valchev, I.; Valentin, F.; Vasilyev, S.; Veljanovska, F.; Venelinova, S.; Veselovskaya, E.; Viola, T.; Virag, C.; Zaninović, J.; Zäuner, S.; Stockhammer, P. W.; Catalano, G.; Krauß, R.; Caramelli, D.; Zariņa, G.; Gaydarska, B.; Lillie, M.; Nikitin, A. G.; Potekhina, I.; Papathanasiou, A.; Borić, D.; Bonsall, C.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Reich, D.: The genomic history of southeastern Europe. Nature 555 (7695), 25778, pp. 197 - 203 (2018)
97.
Journal Article
Olalde, I.; Brace, S.; Allentoft, M. E.; Armit, I.; Kristiansen, K.; Booth, T.; Rohland, N.; Mallick, S.; Szécsényi-Nagy, A.; Mittnik, A. et al.; Altena, E.; Lipson, M.; Lazaridis, I.; Harper, T. K.; Patterson, N.; Broomandkhoshbacht, N.; Diekmann, Y.; Faltyskova, Z.; Fernandes, D.; Ferry, M.; Harney, E.; de Knijff, P.; Michel, M.; Oppenheimer, J.; Stewardson, K.; Barclay, A.; Alt, K. W.; Liesau, C.; Ríos, P.; Blasco, C.; Miguel, J. V.; García, R. M.; Fernández, A. A.; Bánffy, E.; Bernabò-Brea, M.; Billoin, D.; Bonsall, C.; Bonsall, L.; Allen, T.; Büster, L.; Carver, S.; Navarro, L. C.; Craig, O. E.; Cook, G. T.; Cunliffe, B.; Denaire, A.; Dinwiddy, K. E.; Dodwell, N.; Ernée, M.; Evans, C.; Kuchařík, M.; Farré, J. F.; Fowler, C.; Gazenbeek, M.; Pena, R. G.; Haber-Uriarte, M.; Haduch, E.; Hey, G.; Jowett, N.; Knowles, T.; Massy, K.; Pfrengle, S.; Lefranc, P.; Lemercier, O.; Lefebvre, A.; Martínez, C. H.; Olmo, V. G.; Ramírez, A. B.; Maurandi, J. L.; Majó, T.; McKinley, J. I.; McSweeney, K.; Mende, B. G.; Mod, A.; Kulcsár, G.; Kiss, V.; Czene, A.; Patay, R.; Endrődi, A.; Köhler, K.; Hajdu, T.; Szeniczey, T.; Dani, J.; Bernert, Z.; Hoole, M.; Cheronet, O.; Keating, D.; Velemínský, P.; Dobeš, M.; Candilio, F.; Brown, F.; Fernández, R. F.; Herrero-Corral, A.-M.; Tusa, S.; Carnieri, E.; Lentini, L.; Valenti, A.; Zanini, A.; Waddington, C.; Delibes, G.; Guerra-Doce, E.; Neil, B.; Brittain, M.; Luke, M.; Mortimer, R.; Desideri, J.; Besse, M.; Brücken, G.; Furmanek, M.; Hałuszko, A.; Mackiewicz, M.; Rapiński, A.; Leach, S.; Soriano, I.; Lillios, K. T.; Cardoso, J. L.; Pearson, M. P.; Włodarczak, P.; Price, T. D.; Prieto, P.; Rey, P.-J.; Risch, R.; Guerra, R.; A., M.; Schmitt, A.; Serralongue, J.; Silva, A. M.; Smrčka, V.; Vergnaud, L.; Zilhão, J.; Caramelli, D.; Higham, T.; Thomas, M. G.; Kennett, D. J.; Fokkens, H.; Heyd, V.; Sheridan, A.; Sjögren, K.-G.; Stockhammer, P. W.; Krause, J.; Pinhasi, R.; Haak, W.; Barnes, I.; Lalueza-Fox, C.; Reich, D.: The Beaker phenomenon and the genomic transformation of northwest Europe. Nature 555 (7695), 25738, pp. 190 - 196 (2018)
98.
Journal Article
Vågene, Å. J.; Herbig, A.; Campana, M. G.; García, R.; M., N.; Warinner, C.; Sabin, S.; Spyrou, M. A.; Andrades Valtueña, A.; Huson, D. et al.; Tuross, N.; Bos, K. I.; Krause, J.: Salmonella enterica genomes from victims of a major sixteenth-century epidemic in Mexico. Nature Ecology & Evolution 2 (3), pp. 520 - 528 (2018)
99.
Journal Article
Posth, C.; Nägele, K.; Colleran, H.; Valentin, F.; Bedford, S.; Kami, K. W.; Shing, R.; Buckley, H.; Kinaston, R.; Walworth, M. et al.; Clark, G. R.; Reepmeyer, C.; Flexner, J.; Maric, T.; Moser, J.; Gresky, J.; Kiko, L.; Robson, K. J.; Auckland, K.; Oppenheimer, S. J.; Hill, A. V. S.; Mentzer, A. J.; Zech, J.; Petchey, F.; Roberts, P.; Jeong, C.; Gray, R. D.; Krause, J.; Powell, A.: Language continuity despite population replacement in Remote Oceania. Nature Ecology & Evolution 2 (4), pp. 731 - 740 (2018)
100.
Journal Article
Exposito-Alonso, M.; Becker, C.; Schuenemann, V. J.; Reiter, E.; Setzer, C.; Slovak, R.; Brachi, B.; Hagmann, J.; Grimm, D. G.; Chen, J. et al.; Busch, W.; Bergelson, J.; Ness, R. W.; Krause, J.; Burbano, H. A.; Weigel, D.: The rate and potential relevance of new mutations in a colonizing plant lineage. PLoS Genetics 14 (2), e1007155 (2018)
Go to Editor View