Publications of Johannes Krause

Shafer, A. B. A.; Wolf, J. B. W.; Alves, P. C.; Bergstrom, L.; Bruford, M. W.; Brannstrom, I.; Colling, G.; Dalen, L.; De Meester, L.; Ekblom, R. et al.; Fawcett, K. D.; Fior, S.; Hajibabaei, M.; Hill, J. A.; Hoezel, A. R.; Hoglund, J.; Jensen, E. L.; Krause, J.; Kristensen, T. N.; Kruetzen, M.; McKay, J. K.; Norman, A. J.; Ogden, R.; Osterling, E. M.; Ouborg, N. J.; Piccolo, J.; Popovic, D.; Primmer, C. R.; Reed, F. A.; Roumet, M.; Salmona, J.; Schenekar, T.; Schwartz, M. K.; Segelbacher, G.; Senn, H.; Thaulow, J.; Valtonen, M.; Veale, A.; Vergeer, P.; Vijay, N.; Vila, C.; Weissensteiner, M.; Wennerstrom, L.; Wheat, C. W.; Zielinski, P.: Genomics and the challenging translation into conservation practice. Trends in Ecology and Evolution 30 (2), 009, pp. 78 - 87 (2015)

Bos, K. I.; Jaeger, G.; Schuenemann, V. J.; Vågene, Å. J.; Spyrou, M. A.; Herbig, A.; Nieselt, K.; Krause, J.: Parallel detection of ancient pathogens via array-based DNA capture. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences 370 (1660), 20130375, pp. 1 - 5 (2015)

Harkins, K. M.; Buikstra, J. E.; Campbell, T.; Bos, K. I.; Johnson, E. D.; Krause, J.; Stone, A. C.: Screening ancient tuberculosis with qPCR: challenges and opportunities. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences 370 (1660), 20130622, pp. 1 - 10 (2015)

Krause, J.: Ancient human migrations. Die Kunde 64, pp. 87 - 99 (2015)

Yoshida, K.; Burbano, H. A.; Krause, J.; Thines, M.; Weigel, D.; Kamoun, S.: Mining herbaria for plant pathogen genomes: Back to the future. PLoS Pathogens 10 (4), e1004028 (2014)

Mendum, T. A.; Schuenemann, V. J.; Roffey, S.; Taylor, G. M.; Wu, H.; Singh, P.; Tucker, K.; Hinds, J.; Cole, S. T.; Kierzek, A. M. et al.; Nieselt, K.; Krause, J.; Stewart, G. R.: Mycobacterium leprae genomes from a British medieval leprosy hospital: towards understanding an ancient epidemic. BMC Genomics 15, 270 (2014)

Bos, K. I.; Harkins, K. M.; Herbig, A.; Coscolla, M.; Weber, N.; Comas, I.; Forrest, S. A.; Bryant, J. M.; Harris, S. R.; Schuenemann, V. J. et al.; Campbell, T. J.; Majander, K.; Wilbur, A. K.; Guichon, R. A.; Steadman, D. L. W.; Cook, D. C.; Niemann, S.; Behr, M. A.; Zumarraga, M.; Bastida, R.; Huson, D.; Nieselt, K.; Young, D.; Parkhill, J.; Buikstra, J. E.; Gagneux, S.; Stone, A. C.; Krause, J.: Pre-Columbian mycobacterial genomes reveal seals as a source of New World human tuberculosis. Nature 514 (7523), 13591, pp. 494 - 497 (2014)

Krause, J.: Die molekulare Stammesgeschichte des Menschen: Steckt in uns allen ein kleiner Neandertaler? Senckenberg: Natur, Forschung, Museum; das Senckenberg-Wissenschaftsmagazin 144 (7/8), pp. 274 - 277 (2014)

Lazaridis, I.; Patterson, N.; Mittnik, A.; Renaud , G.; Mallick, S.; Kirsanow, K.; Sudmant, P. H.; Schraiber, J. G.; Castellano, S.; Lipson, M. et al.; Berger, B.; Economou, C.; Bollongino, R.; Fu, Q.; Bos, K. I.; Nordenfelt, S.; Li, H.; De Filippo, C.; Pruefer, K.; Sawyer, S.; Posth, C.; Haak, W.; Hallgren, F.; Fornander, E.; Rohland, N.; Delsate, D.; Francken, M.; Guinet, J.-M.; Wahl, J.; Ayodo, G.; Babiker, H. A.; Bailliet, G.; Balanovska, E.; Balanovsky, O.; Barrantes, R.; Bedoya, G.; Ben-Ami, H.; Bene, J.; Berrada, F.; Bravi, C. M.; Brisighelli, F.; Busby, G. B. J.; Cali, F.; Churnosov, M.; Cole, D. E. C.; Corach, D.; Damba, L.; van Driem, G.; Dryomov, S.; Dugoujon, J.-M.; Fedorova, S. A.; Romero, I. G.; Gubina, M.; Hammer, M.; Henn, B. M.; Hervig, T.; Hodoglugil, U.; Jha, A. R.; Karachanak-Yankova, S.; Khusainova, R.; Khusnutdinova, E.; Kittles, R.; Kivisild, T.; Klitz, W.; Kucinskas, V.; Kushniarevich, A.; Laredj, L.; Litvinov, S.; Loukidis, T.; Mahley, R. W.; Melegh, B.; Metspalu, E.; Molina, J.; Mountain, J.; Nakkalajarvi, K.; Nesheva, D.; Nyambo, T.; Osipova, L.; Parik, J.; Platonov, F.; Posukh, O.; Romano, V.; Rothhammer, F.; Rudan, I.; Ruizbakiev, R.; Sahakyan, H.; Sajantila, A.; Salas, A.; Starikovskaya, E. B.; Tarekegn, A.; Toncheva, D.; Turdikulova, S.; Uktveryte, I.; Utevska, O.; Vasquez, R.; Villena, M.; Voevoda, M.; Winkler, C. A.; Yepiskoposyan, L.; Zalloua, P.; Zemunik, T.; Cooper, A.; Capelli, C.; Thomas, M. G.; Ruiz-Linares, A.; Tishkoff, S. A.; Singh, L.; Thangaraj, K.; Villems, R.; Comas, D.; Sukernik, R.; Metspalu, M.; Meyer, M.; Eichler, E. E.; Burger, J.; Slatkin, M.; Paeaebo, S.; Kelso, J.; Reich, D.; Krause, J.: Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature 513 (7518), 13673, pp. 409 - 413 (2014)

Schünemann, V. J.; Krause, J.: Wo der Mensch auf den Hund kam: Genetische Untersuchungen deuten darauf hin, dass der Ursprung der Domestikation in Europa liegt. Senckenberg: Natur, Forschung, Museum; das Senckenberg-Wissenschaftsmagazin 144 (7/8), pp. 278 - 281 (2014)

Skoglund, P.; Northoff, B. H.; Shunkov, M. V.; Derevianko, A. P.; Pääbo, S.; Krause, J.; Jakobsson, M.: Separating endogenous ancient DNA from modern day contamination in a Siberian Neandertal. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 111 (6), 1318934111, pp. 2229 - 2234 (2014)

Thalmann, O.; Shapiro, B.; Chi, P.; Schuenemann, V. J.; Sawyer, S.; Greenfield, D. L.; Germonpré, M. B.; Sablin, M. V.; López-Giráldez, F.; Domingo-Roura, X. et al.; Napierala, H.; Uerpmann, H.-P.; Loponte, D. M.; Acosta, A. A.; Giemsch, L.; Schmitz, R. W.; Worthington, B.; Buikstra, J. E.; Druzhkova, A.; Graphodatsky, A. S.; Ovodov, N. D.; Wahlberg, N.; Freedman, A. H.; Schweizer, R. M.; Koepfli, K.-P.; Leonard, J. A.; Meyer, M.; Krause, J.; Pääbo, S.; Green, R. E.; Wayne, R. K.: Complete mitochondrial genomes of ancient canids suggest a European origin of domestic dogs. Science 342 (6160), 1243650, pp. 871 - 874 (2013)

Schuenemann, V. J.; Singh, P.; Mendum, T. A.; Krause-Kyora, B.; Jaeger, G.; Bos, K.; Herbig, A.; Economou, C.; Benjak, A.; Busso, P. et al.; Nebel, A.; Boldsen, J. L.; Kjellstrom, A.; Wu, H.; Stewart, G. R.; Taylor, G. M.; Bauer, P.; Lee, O. Y. -.; Wu, H. H. T.; Minnikin, D. E.; Besra, G. S.; Tucker, K.; Roffey, S.; Sow, S. O.; Cole, S. T.; Nieselt, K.; Krause, J.: Genome-wide comparison of medieval and modern Mycobacterium leprae. Science 341 (6142), pp. 179 - 183 (2013)

Guschanski, K.; Krause, J.; Sawyer, S.; Valente, L. M.; Bailey, S.; Finstermeier, K.; Sabin, R.; Gilissen, E.; Sonet, G.; Nagy, Z. T. et al.; Lenglet, G.; Mayer, F.; Savolainen, V.: Next-generation museomics disentangles one of the largest primate radiations. Systematic Biology 62 (4), pp. 539 - 554 (2013)

Yoshida, K.; Schuenemann, V. J.; Cano, L. M.; Pais, M.; Mishra, B.; Sharma, R.; Lanz, C.; Martin, F. N.; Kamoun, S.; Krause, J. et al.; Thines, M.; Weigel, D.; Burbano, H. A.: The rise and fall of the Phytophthora infestans lineage that triggered the Irish potato famine. eLife 2, e01108 (2013)

Fu, Q.; Mittnik, A.; Johnson, P. L. F.; Bos, K. I.; Lari, M.; Bollongino, R.; Sun, C.; Giemsch, L.; Schmitz, R.; Burger, J. et al.; Ronchitelli, A. M.; Martini, F.; Cremonesi, R. G.; Svoboda, J.; Bauer, P.; Caramelli, D.; Castellano, S.; Reich, D.; Paeaebo, S.; Krause, J.: A revised timescale for human evolution based on ancient mitochondrial genomes. Current Biology 23 (7), pp. 553 - 559 (2013)

Bos, K. I.; Stevens, P.; Nieselt, K.; Poinar, H. N.; DeWitte, S. N.; Krause, J.: Yersinia pestis: new evidence for an old infection. PLoS One 7 (11), e49803 (2012)

Krause, J.: Human origins and the search for “Missing Links”. PLoS Biology 10 (5), e1001333 (2012)

Sawyer, S.; Krause, J.; Guschanski, K.; Savolainen, V.; Päabo, S.: Temporal patterns of nucleotide misincorporations and DNA fragmentation in ancient DNA. PLoS One 7 (3), e34131 (2012)

Fu, Q.; Rudan, P.; Paeaebo, S.; Krause, J.: Complete mitochondrial genomes reveal neolithic expansion into Europe. PLoS One 7 (3), e32473 (2012)