Publications of Johannes Krause

Forth, J. H.; Forth, L. F.; Lycett, S.; Bell-Sakyi, L.; Keil, G. M.; Blome, S.; Calvignac-Spencer, S.; Wissgott, A.; Krause, J.; Höper, D. et al.; Kampen, H.; Beer, M.: Identification of African swine fever virus-like elements in the soft tick genome provides insights into the virus’ evolution. BMC Biology 18 (1), 136 (2020)

Siebke, I.; Furtwängler, A.; Steuri, N.; Hafner, A.; Ramstein, M.; Krause, J.; Lösch, S.: Crops vs. animals: regional differences in subsistence strategies of Swiss Neolithic farmers revealed by stable isotopes. Archaeological and Anthropological Sciences 12 (10), 235, pp. 1 - 30 (2020)

Barquera, R.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Bravo-Acevedo, A.; Arrieta-Bolaños, E.; Clayton, S.; Acuña-Alonzo, V.; Martínez-Álvarez, J. C.; López-Gil, C.; Adalid-Sáinz, C.; Vega-Martínez, M. d. R. et al.; Escobedo-Ruíz, A.; Juárez-Cortés, E. D.; Immel, A.; Pacheco-Ubaldo, H.; González-Medina, L.; Lona-Sánchez, A.; Lara-Riegos, J.; Sánchez-Fernández, M. G. d. J.; Díaz-López, R.; Guizar-López, G. U.; Medina-Escobedo, C. E.; Arrazola-García, M. A.; Montiel-Hernández, G. D.; Hernández-Hernández, O.; la Cruz, R.-d.; Rocío, F. d.; Juárez-Nicolás, F.; Pantoja-Torres, J. A.; Rodríguez-Munguía, T. J.; Juárez-Barreto, V.; Delgado-Aguirre, H.; Escutia-González, A. B.; Goné-Vázquez, I.; Benítez-Arvizu, G.; Arellano-Prado, F. P.; García-Arias, V. E.; Rodríguez-López, M. E.; Méndez-Mani, P.; García-Álvarez, R.; González-Martínez, M. d. R.; Aquino-Rubio, G.; Escareño-Montiel, N.; Vázquez-Castillo, T. V.; Uribe-Duarte, M. G.; Ruíz-Corral, M. d. J.; Ortega-Yáñez, A.; Bernal-Felipe, N.; Gómez-Navarro, B.; Arriaga-Perea, A. J.; Martínez-Bezies, V.; Macías-Medrano, R. M.; Aguilar-Campos, J. A.; Solís-Martínez, R.; Serrano-Osuna, R.; Sandoval-Sandoval, M. J.; Jaramillo-Rodríguez, Y.; Salgado-Adame, A.; Juárez-de la Cruz, F.; Novelo-Garza, B.; Pavón-Vargas, M. d. l. Á.; Salgado-Galicia, N.; Bortolini, M. C.; Gallo, C.; Bedoya, G.; Rothhammer, F.; González-José, R.; Ruiz-Linares, A.; Canizales-Quinteros, S.; Romero-Hidalgo, S.; Krause, J.; Zúñiga, J.; Yunis, E. J.; Bekker-Méndez, C.; Granados, J.: The immunogenetic diversity of the HLA system in Mexico correlates with underlying population genetic structure. Human Immunology 81 (9), 2020.06.008, pp. 461 - 474 (2020)

Neukamm, J.; Pfrengle, S.; Molak, M.; Seitz, A.; Francken, M.; Eppenberger, P.; Avanzi, C.; Reiter, E.; Urban, C.; Welte, B. et al.; Stockhammer, P. W.; Teßmann, B.; Herbig, A.; Harvati, K.; Nieselt, K.; Krause, J.; Schuenemann, V. J.: 2000-year-old pathogen genomes reconstructed from metagenomic analysis of Egyptian mummified individuals. BMC Biology 18 (1), 108 (2020)

Majander, K.; Pfrengle, S.; Kocher, A.; Neukamm, J.; du Plessis, L.; Pla-Díaz, M.; Arora, N.; Akgül, G.; Salo, K.; Schats, R. et al.; Inskip, S.; Oinonen, M.; Valk, H.; Malve, M.; Kriiska, A.; Onkamo, P.; González-Candelas, F.; Kühnert, D.; Krause, J.; Schuenemann, V. J.: Ancient bacterial genomes reveal a high diversity of Treponema pallidum Strains in early Modern Europe. Current Biology 30 (19), 2020.07.058, pp. 3788 - 3803.e10 (2020)

Barquera, R.; Krause, J.: An ancient view on host pathogen interaction across time and space. Current Opinion in Immunology 65, pp. 65 - 69 (2020)

Nägele, K.; Posth, C.; Iraeta Orbegozo, M.; Chinique de Armas, Y.; Godoy, H.; Teresita, S.; Herrera, G.; M., U.; Nieves-Colón, M. A.; Sandoval-Velasco, M. et al.; Mylopotamitaki, D.; Radzeviciute, R.; Laffoon, J.; Pestle, W. J.; Ramos-Madrigal, J.; Lamnidis, T. C.; Schaffer, W. C.; Carr, R. S.; Day, J. S.; Arredondo Antúnez, C.; Rangel Rivero, A.; Martínez-Fuentes, A. J.; Crespo-Torres, E.; Roksandic, I.; Stone, A. C.; Lalueza-Fox, C.; Hoogland, M.; Roksandic, M.; Hofman, C. L.; Krause, J.; Schroeder, H.: Genomic insights into the early peopling of the Caribbean. Science 369 (6502), eaba8697, pp. 456 - 460 (2020)

Wang, K.; Goldstein, S. T.; Bleasdale, M.; Clist, B.; Bostoen, K.; Bakwa-Lufu, P.; Buck, L. T.; Crowther, A.; Dème, A.; McIntosh, R. J. et al.; Mercader, J.; Ogola, C.; Power, R. C.; Sawchuk, E. A.; Robertshaw, P.; Wilmsen, E. N.; Petraglia, M. D.; Ndiema, E.; Manthi, F. K.; Krause, J.; Roberts, P.; Boivin, N. L.; Schiffels, S.: Ancient genomes reveal complex patterns of population movement, interaction, and replacement in sub-Saharan Africa. Science Advances 6 (24), eaaz0183 (2020)

Yu, H.; Spyrou, M. A.; Karapetian, M.; Shnaider, S.; Radzeviciute, R.; Nägele, K.; Neumann, G. U.; Penske, S. E.; Zech, J.; Lucas, M. et al.; LeRoux, P.; Roberts, P.; Pavlenok, G.; Buzhilova, A.; Posth, C.; Jeong, C.; Krause, J.: Paleolithic to Bronze Age Siberians reveal connections with first Americans and across Eurasia. Cell 181 (6), 2020.04.037, pp. 1232 - 1245.e20 (2020)

Barquera, R.; Lamnidis, T. C.; Lankapalli, A. K.; Kocher, A.; Hernández-Zaragoza, D. I.; Nelson, E. A.; Zamora-Herrera, A. C.; Perez Ramallo, P.; Bernal-Felipe, N.; Immel, A. et al.; Bos, K.; Acuña-Alonzo, V.; Barbieri, C.; Roberts, P.; Herbig, A.; Kühnert, D.; Márquez-Morfín, L.; Krause, J.: Origin and health status of first-generation Africans from early colonial Mexico. Current Biology 30 (11), 2020.04.002, pp. 2078 - 2091.e11 (2020)

Ning, C.; Li, T.; Wang, K.; Zhang, F.; Li, T.; Wu, X.; Gao, S.; Zhang, Q.; Zhang, H.; Hudson, M. et al.; Dong, G.; Wu, S.; Fang, Y.; Liu, C.; Feng, C.; Li, W.; Han, T.; Li, R.; Wei, J.; Zhu, Y.; Zhou, Y.; Wang, C.-C.; Fan, S.; Xiong, Z.; Sun, Z.; Ye, M.; Sun, L.; Wu, X.; Liang, F.; Cao, Y.; Wei, X.; Zhu, H.; Zhou, H.; Krause, J.; Robbeets, M.; Jeong, C.; Cui, Y.: Ancient genomes from northern China suggest links between subsistence changes and human migration. Nature Communications 11, 2700 (2020)

Skourtanioti, E.; Erdal, Y. S.; Frangipane, M.; Balossi Restelli, F.; Yener, K. A.; Pinnock, F.; Matthiae, P.; Özbal, R.; Schoop, U.-D.; Guliyev, F. et al.; Akhundov, T.; Lyonnet, B.; Hammer, E. L.; Nugent, S. E.; Burri, M.; Neumann, G. U.; Penske, S. E.; Ingman, T.; Akar, M.; Shafiq, R.; Palumbi, G.; Eisenmann, S.; D’Andrea, M.; Rohrlach, A. B.; Warinner, C.; Jeong, C.; Stockhammer, P. W.; Haak, W.; Krause, J.: Genomic history of Neolithic to Bronze Age Anatolia, Northern Levant, and Southern Caucasus. Cell 181 (5), 2020.04.044, pp. 1158 - 1175.e28 (2020)

Rivollat, M.; Jeong, C.; Schiffels, S.; Kücükkalıpcı, İ.; Pemonge, M.-H.; Rohrlach, A. B.; Alt, K. W.; Binder, D.; Friederich, S.; Ghesquière, E. et al.; Gronenborn, D.; Laporte, L.; Lefranc, P.; Meller, H.; Réveillas, H.; Rosenstock, E.; Rottier, S.; Scarre, C.; Soler, L.; Wahl, J.; Krause, J.; Deguilloux, M.-F.; Haak, W.: Ancient genome-wide DNA from France highlights the complexity of interactions between Mesolithic hunter-gatherers and Neolithic farmers. Science Advances 6 (22), eaaz5344 , pp. 1 - 16 (2020)

Nakatsuka, N.; Lazaridis, I.; Barbieri, C.; Skoglund, P.; Rohland, N.; Mallick, S.; Posth, C.; Harkins-Kinkaid, K.; Ferry, M.; Harney, É. et al.; Michel, M.; Stewardson, K.; Novak-Forst, J.; Capriles, J. M.; Durruty, M. A.; Álvarez, K. A.; Beresford-Jones, D.; Burger, R.; Cadwallader, L.; Fujita, R.; Isla, J.; Lau, G.; Aguirre, C. L.; LeBlanc, S.; Maldonado, S. C.; Meddens, F.; Messineo, P. G.; Culleton, B. J.; Harper, T. K.; Quilter, J.; Politis, G.; Rademaker, K.; Reindel, M.; Rivera, M.; Salazar, L.; Sandoval, J. R.; Santoro, C. M.; Scheifler, N.; Standen, V.; Barreto, M. I.; Espinoza, I. F.; Tomasto-Cagigao, E.; Valverde, G.; Kennett, D. J.; Cooper, A.; Krause, J.; Haak, W.; Llamas, B.; Reich, D.; Fehren-Schmitz, L.: A paleogenomic reconstruction of the deep population history of the Ande. Cell, 2020.04.015 (2020)

Loog, L.; Thalmann, O.; Sinding, M.-H. S.; Schuenemann, V. J.; Perri, A.; Germonpré, M.; Bocherens, H.; Witt, K. E.; Samaniego Castruita, J. A.; Velasco, M. S. et al.; Lundstrøm, I. K. C.; Wales, N.; Sonet, G.; Frantz, L.; Schroeder, H.; Budd, J.; Jimenez, E.-L.; Fedorov, S.; Gasparyan, B.; Kandel, A. W.; Lázničková-Galetová, M.; Napierala, H.; Uerpmann, H.-P.; Nikolskiy, P. A.; Pavlova, E. Y.; Pitulko, V. V.; Herzig, K.-H.; Malhi, R. S.; Willerslev, E.; Hansen, A. J.; Dobney, K.; Gilbert, M. T. P.; Krause, J.; Larson, G.; Eriksson, A.; Manica, A.: Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia. Molecular Ecology 29 (9), 15329, pp. 1596 - 1610 (2020)

Musralina , L. Z.; Djansugurova , L. B.; Krause, J.: Features of the study of ancient pathogens. Журнал проблем эволюции открытых систем 22 (1), pp. 83 - 89 (2020)

Furtwängler, A.; Rohrlach, A. B.; Lamnidis, T. C.; Papac, L.; Neumann, G.; Siebke, I.; Reiter, E.; Steuri, N.; Hald, J.; Denaire, A. et al.; Schnitzler, B.; Wahl, J.; Ramstein, M.; Schuenemann, V. J.; Stockhammer, P. W.; Hafner, A.; Lösch, S.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J.: Ancient genomes reveal social and genetic structure of Late Neolithic Switzerland. Nature Communications 11, 1915 (2020)

Key, F. M.; Posth, C.; Esquivel Gomez, L. R.; Hübler, R.; Spyrou, M. A.; Neumann, G. U.; Furtwängler, A.; Sabin, S.; Burri Promerová, M.; Wissgott, A. et al.; Lankapalli, A. K.; Vågene, Å. J.; Meyer, M.; Nagel, S.; Tukhbatova, R.; Khokhlov, A.; Chizhevsky, A.; Hansen, S.; Belinsky, A. B.; Kalmykov, A.; Kantorovich, A. R.; Maslov, V. E.; Stockhammer, P. W.; Vai, S.; Zavattaro, M.; Riga, A.; Caramelli, D.; Skeates, R.; Beckett, J.; Gradoli, M. G.; Steuri, N.; Hafner, A.; Ramstein, M.; Siebke, I.; Lösch, S.; Erdal, Y. S.; Alikhan, N.-F.; Zhou, Z.; Achtman, M.; Bos, K.; Reinhold, S.; Haak, W.; Kühnert, D.; Herbig, A.; Krause, J.: Emergence of human-adapted Salmonella enterica is linked to the Neolithization process. Nature Ecology & Evolution 4 (3), pp. 324 - 333 (2020)

Fischer, M. S.; Hoßfeld, U.; Krause, J.; Richter, S.: Jena, Haeckel und die Frage nach den Menschenrassen oder der Rassismus macht Rassen [Preprint]. Zoologie: Mitteilungen der Deutschen Zoologischen Gesellschaft 2020, pp. 7 - 32 (2020)

Marcus, J. H.; Posth, C.; Ringbauer, H.; Lai, L.; Skeates, R.; Sidore, C.; Beckett, J.; Furtwängler, A.; Olivieri, A.; Chiang, C. W. K. et al.; Al-Asadi, H.; Dey, K.; Joseph, T. A.; Liu, C.-C.; Der Sarkissian, C.; Radzeviciute, R.; Michel, M.; Gradoli, M. G.; Marongiu, P.; Rubino, S.; Mazzarello, V.; Rovina, D.; La Fragola, A.; Serra, R. M.; Bandiera, P.; Bianucci, R.; Pompianu, E.; Murgia, C.; Guirguis, M.; Orquin, R. P.; Tuross, N.; van Dommelen, P.; Haak, W.; Reich, D.; Schlessinger, D.; Cucca, F.; Krause, J.; Novembre, J.: Genetic history from the Middle Neolithic to present on the Mediterranean island of Sardinia. Nature Communications 11 (1), 939, pp. 1 - 14 (2020)